MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_5

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017330	TTC	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545960
2	NC_017330	GCC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545960
3	NC_017330	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545960
4	NC_017330	TCCTG	2	10	460	469	0 %	40 %	20 %	40 %	384545961
5	NC_017330	ATAA	2	8	507	514	75 %	25 %	0 %	0 %	384545961
6	NC_017330	TGCAG	2	10	521	530	20 %	20 %	40 %	20 %	384545961
7	NC_017330	AAT	2	6	576	581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545961
8	NC_017330	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
9	NC_017330	GCG	2	6	832	837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545962
10	NC_017330	GT	3	6	840	845	0 %	50 %	50 %	0 %	384545962
11	NC_017330	T	7	7	845	851	0 %	100 %	0 %	0 %	384545962
12	NC_017330	GCT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
13	NC_017330	GC	3	6	1107	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	384545963
14	NC_017330	ACA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
15	NC_017330	GAA	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
16	NC_017330	GCA	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545964
17	NC_017330	TTG	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
18	NC_017330	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	384545964
19	NC_017330	TTTTG	2	10	1378	1387	0 %	80 %	20 %	0 %	384545964
20	NC_017330	CTG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
21	NC_017330	CTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
22	NC_017330	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
23	NC_017330	ATC	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
24	NC_017330	TTATG	2	10	1579	1588	20 %	60 %	20 %	0 %	384545964
25	NC_017330	ATT	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
26	NC_017330	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
27	NC_017330	TGA	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545964
28	NC_017330	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
29	NC_017330	TGTA	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	384545964
30	NC_017330	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
31	NC_017330	AAG	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
32	NC_017330	TGT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
33	NC_017330	ATTA	2	8	1778	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	384545964
34	NC_017330	TTG	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
35	NC_017330	ATT	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
36	NC_017330	A	7	7	1960	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	384545964
37	NC_017330	A	6	6	2057	2062	100 %	0 %	0 %	0 %	384545964
38	NC_017330	TCAA	2	8	2063	2070	50 %	25 %	0 %	25 %	384545964
39	NC_017330	TGT	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
40	NC_017330	TTCT	2	8	2232	2239	0 %	75 %	0 %	25 %	384545964
41	NC_017330	TA	3	6	2270	2275	50 %	50 %	0 %	0 %	384545964
42	NC_017330	G	6	6	2689	2694	0 %	0 %	100 %	0 %	384545965
43	NC_017330	CA	3	6	2701	2706	50 %	0 %	0 %	50 %	384545965

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.